为适应“十三五”期间我院水利规划设计工作发展的需求，提高我院核心竞争力，进一步优化我院专业布局，提高工作效率，2016年经院领导班子研究决定，工程总承包公司独立办公。项目管理处为全院工程总承包业务发展的归口管理部门，负责工程总承包业务管理平台的建设，组织开展总承包业务的风险评估及项目的合同评审，负责监控总承包项目总体实施状况。

工程项目总承包业务通过优化设计，优化施工组织设计，按照科学化管理、精细化施工的原则，抓好质量与安全、确保工程进度、严格控制工程造价，最终实现总承包全面目标。我院集中各部门优秀技术力量，组建专业的设计、管理团队，对整个项目统筹规划、协同运作，有效解决设计与施工的衔接问题、减少采购与施工的中间环节，顺利解决施工方案中的实用性、技术性、安全性之间的矛盾，体现了总承包管理模式的优势。

2016年10月我院承揽了大安灌区长征片区施工图勘察设计、采购及施工（EPC）总承包项目，该项目是吉林省水利厅针对包保帮扶的贫困村—长征村，实施的精准扶贫、精准脱贫的基础设施项目，更具有产业扶贫项目功能。2018年9月大安灌区长征片区工程试车通水成功，为长征村新增水田面积1.1万亩，从根本上解决长征村脱贫问题，为实现致富奔小康目标提供了坚实保障。

2019年我院承揽的吉林省水利发展“十三五”规划中的重点项目——乾安县花敖泡蓄水调蓄工程项目总承包工程目前仍在建设中，该工程总投资10个亿，该工程为花敖泡内春捺钵遗址保护工程，主要由挡水土坝、排水泵站及排水沟等建筑物组成。本工程挡水土坝折线形布置，坝长8046.22米，最大坝高17.6米。工程的建设对于促进吉林西部经济发展、改善生态环境，保护历史遗址群等作用巨大。

2022年我院承揽了图们市净水厂工程设计、采购、施工总承包项目，总投资1.7个亿，主要任务是新建一座净水厂、新建两条供水管线、新建一条排污管线及场外道路等配套设施，项目建成将改善图们市供水现状，解决供水系统存在的问题，保障居民饮水安全和身体健康，保证城乡一体化发展进程顺利进行。